Pri nepriamom spaľovaní sa teplo vznikajúce pri spaľovaní paliva využíva na ohrev iného média, napríklad vody alebo vzduchu, ktoré potom rozvádza teplo do priestoru. Tento proces je účinnejší a šetrnejší k životnému prostrediu, pretože emisie môžu byť nižšie a teplo sa odovzdáva efektívnejšie. Nepriame spaľovanie sa bežne používa v moderných kotloch a vykurovacích systémoch.