Nivelácia mikrotrhlín popisuje schopnosť silikónového tmelu pri aplikácii samovoľne vyplniť a vyhladiť veľmi jemné, vlasové praskliny v podklade. Táto vlastnosť súvisí s konzistenciou a tekutosťou tmelu. Silikón s dobrou nivelačnou schopnosťou dokáže mierne „zatiecť“ do nerovností a pórov materiálu, čím vytvára nielen esteticky hladší spoj, ale predovšetkým zaisťuje dokonalé priľnutie a utesnenie spoja. Materiály bez tejto vlastnosti by mohli nad mikrotrhlinami tvoriť drobné mostíky, pod ktorými by zostali nevyplnené dutiny, čo by mohlo znížiť tesnosť a životnosť spoja. Ide teda o schopnosť tmelu vytvoriť súvislý a plne kontaktný povrch aj na podkladoch, ktoré nie sú dokonale hladké.