Ochrana proti zamrznutiu je automatická funkcia, ktorá bráni poškodeniu tepelného čerpadla v chladnom počasí. Voda, ktorá zostáva v tepelnom výmenníku čerpadla, by pri teplotách pod bodom mrazu mohla zamrznúť. Keďže ľad má väčší objem ako voda, mohol by tento proces nezvratne poškodiť, alebo dokonca roztrhnúť, citlivé vnútorné súčasti zariadenia. Funkcia sa aktivuje, akonáhle snímače zaznamenajú pokles teploty k rizikovej hranici, a spustí obeh vody alebo krátkodobý ohrev, aby sa udržala teplota vo vnútri čerpadla nad bodom mrazu.