Plánovanie trasy je proces vytvorenia vopred definovanej letovej dráhy, ktorú dron autonómne preletí. Pomocou špecializovaného softvéru, napríklad v mobilnej aplikácii alebo počítačovom programe, užívateľ na mapovom podklade definuje sériu bodov, takzvaných „traťových bodov“ alebo anglicky „waypoints“. Každý takýto bod predstavuje konkrétnu zemepisnú súradnicu, ku ktorej dron doletí. Pri jednotlivých traťových bodoch je často možné nastaviť ďalšie parametre, ako je výška letu, rýchlosť, smer, ktorým bude dron natočený, alebo akcie, ktoré má na danom mieste vykonať – napríklad urobiť fotografiu, začať nahrávanie videa alebo sa na chvíľu zastaviť. Po nahratí kompletného letového plánu do dronu je misia spustená a dron ju vykoná automaticky od vzletu až po pristátie, pričom pilot má zvyčajne možnosť v prípade potreby prevziať ručné riadenie. Tento spôsob letu sa využíva predovšetkým pre úlohy vyžadujúce presnosť a opakovateľnosť, ako je mapovanie terénu, inšpekcia budov a infraštruktúry alebo aplikácie v poľnohospodárstve.